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PETCT检查除了将18F-FDG放射性示踪剂插到静脉血管时会感到轻微的刺痛，而且还会伴随着一点冷，一般没有其他副作用，所以大多数核医学过程是无痛的，很少引起不适或副作用。 口服18F-FDG放射性示踪剂，该示踪剂是无色无味，闻起来也完全没有味道。有一些流程，当导管放置到膀胱的时候，会造成暂时的不适，这时一定要坚持到图像记录完成。 人体在被PETCT扫描时，核成像本身不会引起疼痛。如果有幽闭恐惧症，检查时可能会感到一些焦虑。如检查完，18F-FDG放射性示踪剂通过时间放射性衰变过程，放射性示踪剂会在身体慢慢失去放射性，18F-FDG放射性示踪剂还可以通过尿液或粪便排出，检查后应该喝大量的水以将18F-FDG放射性示踪剂完全排出。因此，PETCT检查基本是无痛的过程，所以可以抛开这个顾虑。
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